Algunos metadatos no se pueden representar de forma satisfactoria ni en Excel ni mediante Visone o Gephi, sea porque una lista en forma de tabla no aportaría nada por su escaso número de datos, sea porque no se pueden relacionar entre sí. Un ejemplo de ello serían las estructuras jerárquicas en las revistas que se pueden representar en organigramas. Se pueden crear organigramas en Excel, pero sólo dentro de estructuras prefijadas. Y-Ed ofrece para tales casos mayor libertad de diseño. Es un programa que necesita poca introducción y se explica casi por sí mismo, además, en caso de necesidad, se encuentran tutoriales en YouTube, por ejemplo. El programa ofrece gran variedad de símbolos y de conexiones entre los elementos. Permite enfocar aspectos aislados de datos que se han obtenido antes o realizar un análisis pormenorizado de diferentes facetas. Se podría concentrar, por ejemplo, en las autoras de las revistas, creando una estructura de árbol que conecte desde un centro diferentes tipos de contribuciones para cada una de ellas. La herramienta, sin embargo, es útil sólo si se dispone de poca cantidad de datos, ya que ni hay automatización ni se pueden importar series de datos. Cualquier visualización en Y-Ed es puro trabajo manual y requiere mucho tiempo.